ChIRP
發布時間 :2018-02-28
檢測調節RNA結合調控的DNA和蛋白質

 RNA純化的染色質分離技術(Chromatin Isolation by RNA Purification,ChIRP)是一種檢測與RNA綁定的DNA和蛋白的高通量檢測方法。
       其方法是通過設計生物素標記RNA互補探針,其與鏈霉親和素結合,將目標RNA特異性結合的同時,特異性捕獲RNA結合調控的DNA染色體片段及參與轉錄調控的RNA結合蛋白質(RBPs)。

①DNA染色體片段經過構建文庫及高通量測序,可以基因組水平獲得轉錄調控RNA(增強子RNA,eRNA)轉錄調控的下游靶基因,結合qPCR可以研究結合調控強度;
②RNA結合蛋白經過酶消化及高效液相-質譜分析,可以鑒定參與轉錄調控的蛋白質,結合western blot可以進一步研究結合作用強度


客戶提供

① 活細胞(>107cell);

② 新鮮組織:大于0.5g

③ RNA信息、物種信息ID;


伯信提供

① 檢測報告(實驗儀器、試劑、方法、結果、結論);

② 探針組;

③ MS:搜庫結果;

④ ChIRP-DNA:下游靶基因名稱、PCR電泳圖、高通量測序數據


結果實例



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